Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms