Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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Usp20Q8C6M1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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Usp20Q8C6M1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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