Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms