Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FarsaQ8C0C7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FarsaQ8C0C7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FarsaQ8C0C7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FarsaQ8C0C7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FarsaQ8C0C7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FarsaQ8C0C7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FarsaQ8C0C7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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FarsaQ8C0C7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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