Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms