Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 1700023G09Rik-201ENSMUST00000194513 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 1700125H20Rik-201ENSMUST00000018623 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Akap7-202ENSMUST00000095779 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms