Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trerf1Q8BXJ2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms