Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms