Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmod1Q8BVA4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms