Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup54Q8BTS4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms