Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo38Q8BMI0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms