Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms