Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc27Q80YS5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc27Q80YS5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc27Q80YS5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc27Q80YS5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc27Q80YS5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc27Q80YS5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc27Q80YS5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Lrrc27Q80YS5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Lrrc27Q80YS5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Lrrc27Q80YS5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Lrrc27Q80YS5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc27Q80YS5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc27Q80YS5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc27Q80YS5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc27Q80YS5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc27Q80YS5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Lrrc27Q80YS5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Lrrc27Q80YS5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc27Q80YS5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc27Q80YS5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc27Q80YS5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc27Q80YS5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc27Q80YS5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc27Q80YS5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc27Q80YS5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc27Q80YS5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc27Q80YS5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc27Q80YS5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc27Q80YS5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc27Q80YS5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc27Q80YS5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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