Protein–RNA interactions for Protein: Q80XG9

Lrrtm4, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 4, mousemouse

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Length 590 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm4Q80XG9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lrrtm4Q80XG9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrtm4Q80XG9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm4Q80XG9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm4Q80XG9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm4Q80XG9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm4Q80XG9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm4Q80XG9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm4Q80XG9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm4Q80XG9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm4Q80XG9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm4Q80XG9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm4Q80XG9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm4Q80XG9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm4Q80XG9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm4Q80XG9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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