Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD1

Chn2, Beta-chimaerin, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chn2Q80XD1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Chn2Q80XD1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Chn2Q80XD1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms