Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nrde2Q80XC6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms