Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed4Q80WQ9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms