Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms