Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pnma8aQ80VM8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pnma8aQ80VM8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pnma8aQ80VM8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pnma8aQ80VM8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pnma8aQ80VM8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pnma8aQ80VM8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pnma8aQ80VM8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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