Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms