Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf8Q80TJ7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf8Q80TJ7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms