Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMY7

Ipo8, Importin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,010 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipo8Q7TMY7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ipo8Q7TMY7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ipo8Q7TMY7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ipo8Q7TMY7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ipo8Q7TMY7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ipo8Q7TMY7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ipo8Q7TMY7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ipo8Q7TMY7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ipo8Q7TMY7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ipo8Q7TMY7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ipo8Q7TMY7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ipo8Q7TMY7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ipo8Q7TMY7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ipo8Q7TMY7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ipo8Q7TMY7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ipo8Q7TMY7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ipo8Q7TMY7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ipo8Q7TMY7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ipo8Q7TMY7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms