Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM9

Tubb2a, Tubulin beta-2A chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2aQ7TMM9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb2aQ7TMM9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb2aQ7TMM9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms