Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Z0

Rtn4rl2, Reticulon-4 receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rl2Q7M6Z0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rtn4rl2Q7M6Z0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rtn4rl2Q7M6Z0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rtn4rl2Q7M6Z0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rtn4rl2Q7M6Z0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rtn4rl2Q7M6Z0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rtn4rl2Q7M6Z0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rtn4rl2Q7M6Z0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rtn4rl2Q7M6Z0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms