Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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