Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Higd1cQ76I25 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1cQ76I25 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms