Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynmQ70IV5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms