Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms