Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms