Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssx9Q6XAS3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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