Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms