Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PdgfrlQ6PE55 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms