Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms