Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttbk1Q6PCN3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttbk1Q6PCN3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms