Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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Usp49Q6P9L4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Usp49Q6P9L4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Usp49Q6P9L4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Usp49Q6P9L4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp49Q6P9L4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp49Q6P9L4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp49Q6P9L4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Usp49Q6P9L4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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