Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H6

Frmd5, FERM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd5Q6P5H6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frmd5Q6P5H6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frmd5Q6P5H6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms