Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms