Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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