Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms