Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Krt40Q6IFX3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Krt40Q6IFX3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Krt40Q6IFX3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Krt40Q6IFX3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt40Q6IFX3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
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Krt40Q6IFX3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Krt40Q6IFX3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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