Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms