Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms