Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scaf8Q6DID3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms