Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarca2Q6DIC0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca2Q6DIC0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms