Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cep290Q6A078 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cep290Q6A078 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cep290Q6A078 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cep290Q6A078 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cep290Q6A078 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cep290Q6A078 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cep290Q6A078 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cep290Q6A078 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cep290Q6A078 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cep290Q6A078 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cep290Q6A078 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Cep290Q6A078 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Cep290Q6A078 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep290Q6A078 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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