Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
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