Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kiaa1549Q68FD9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms