Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Arhgef39Q66JY6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Arhgef39Q66JY6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Arhgef39Q66JY6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Arhgef39Q66JY6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Arhgef39Q66JY6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Arhgef39Q66JY6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Arhgef39Q66JY6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Arhgef39Q66JY6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms