Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q66JV7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q66JV7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q66JV7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q66JV7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q66JV7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q66JV7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q66JV7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q66JV7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q66JV7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms