Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Capn3Q64691 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Capn3Q64691 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Capn3Q64691 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Capn3Q64691 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Capn3Q64691 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Capn3Q64691 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Capn3Q64691 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Capn3Q64691 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn3Q64691 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms